Scratchbook

In my opinion, we should really agree on one default mode for those particles, as well as the seldom used combinations of them with other particles (では and so on). Either use the transscription ('へ -> e, を -> o, は -> wa, では -> dewa and so on) or the transliteration (へ -> he, を -> wo, は -> ha, では -> deha).

Anime titles which should be changed if we chose transscription:

Japanese title	Current rōmaji title	Fixed rōmaji title
いつも心に太陽を!	Itsumo Kokoro ni Taiyou wo!	Itsumo Kokoro ni Taiyou o!
ウルトラマンキッズ 母をたずねて3000万光年	Ultraman Kids ~Haha wo Tazunete 3000-man Kounen~	Ultraman Kids ~Haha o Tazunete 3000-man Kounen~
エイケン エイケンヴより愛をこめて	Eiken Eikenbu yori Ai wo Komete	Eiken Eikenbu yori Ai o Komete
エースをねらえ!	Ace wo Nerae!	Ace o Nerae!
エースをねらえ！	Ace wo Nerae! (1979)	Ace o Nerae! (1979) This one needs a fixed original title as well, I think
エースをねらえ！２	Ace wo Nerae! 2	Ace o Nerae! 2
「エースをねらえ！」 —ファイナル・ステージ—	Ace wo Nerae: Final Stage	Ace o Nerae: Final Stage
エルフを狩るモノたち	Elf wo Karu Mono-tachi	Elf o Karu Mono-tachi
エルフを狩るモノたち II	Elf wo Karu Mono-tachi II	Elf o Karu Mono-tachi
ダーティペア　ラブリーエンジェルより愛をこめて	Dirty Pair Lovely Angels yori Ai wo Komete	Dirty Pair Lovely Angels yori Ai o Komete
どくとるマンボウ＆怪盗ジバコ　宇宙より愛をこめて	Doctor Mambo & Kaitou Jibako: Uchuu Yori Ai wo Komete	Doctor Mambo & Kaitou Jibako: Uchuu Yori Ai o Komete
トップをねらえ！	Top wo Nerae!	Top o Nerae!
トップをねらえ2！	Top wo Nerae! 2	Top o Nerae! 2
ドラゴンボールＺ オラの悟飯をかえせッ!!	Dragon Ball Z: Ora no Gohan wo Kaese!!	Dragon Ball Z: Ora no Gohan o Kaese!!
らんま１／２　決戦桃幻郷! 花嫁を奪りもどせ!!	Ranma 1/2: Kessen Tougenkyou! Hanayomewo Torimodose!	Ranma 1/2: Kessen Tougenkyou! Hanayome o Torimodose! that one has other problems, as well

Anime titles which should be changed if we chose transliteration:

Japanese title	Current rōmaji title	Fixed rōmaji title
アンジェリーク　聖地より愛をこめて	Angelique - Seichi Yori Ai o Komete	Angelique - Seichi Yori Ai wo Komete
ガラスの仮面～千の仮面を持つ少女～	Glass no Kamen: Sen no Kamen o Motsu Shoujo	Glass no Kamen: Sen no Kamen wo Motsu Shoujo
クレヨンしんちゃん　嵐を呼ぶアッパレ！戦国大合戦	Crayon Shin-chan: Arashi o Yobu Appare! Sengoku Dai Kassen	Crayon Shin-chan: Arashi wo Yobu Appare! Sengoku Dai Kassen
ゼロテスター 地球を守れ！	Zero Tester: Chikyuu o Mamore!	Zero Tester: Chikyuu wo Mamore!
トビラを開けて	Tobira o Akete (1995)	Tobira wo Akete (1995)
ぼくの地球を守って	Boku no Chikyuu o Mamotte	Boku no Chikyuu wo Mamotte
ほとり～たださいわいを希う[こいねがう]	Hotori: Tada Saiwai o Koinegau	Hotori: Tada Saiwai wo Koinegau
らんま１／２　決戦桃幻郷! 花嫁を奪りもどせ!!	Ranma 1/2: Kessen Tougenkyou! Hanayomewo Torimodose!	Ranma 1/2: Kessen Tougenkyou! Hanayome wo Torimodose! that one has other problems, as well

And, finally, anime titles with those particles which don't have a correct rōmaji title as of yet:

Japanese title	Current rōmaji title
クレヨンしんちゃん　嵐を呼ぶ栄光のヤキニクロード	Crayon Shin-chan Movie 2003
クレヨンしんちゃん　嵐を呼ぶ！夕陽のカスカベボーイズ	Crayon Shin-chan Movie 2004
クレヨンしんちゃん　伝説を呼ぶ　ブリブリ　３分ポッキリ大進撃	Crayon Shin-chan Movie 2005

ToDo:

ナポレオンの辞書を奪え
Lupin Sansei: Napoleon no Jisho wo Ubae
ハム太郎のおたんじょうび ～ママをたずねて三千てちてち～
Hamutarou no Otanjobi
バーバパパ　世界をまわる
Barbapapa Sekai wo Mawaru
ヒットをねらえ
Hit wo Nerae
ポケットモンスター セレビィ 時を超えた遭遇
Pocket Monsters: Serebii Toki wo Koeta Deai
マクロス7 -銀河がオレを呼んでいる!-
Macross 7: Ginga ga Ore wo Yonde Iru
ルパン三世『ハリマオの財宝を追え!!』
Lupin Sansei: Harimao no Zaiho wo oe!!
ロシアより愛をこめて
Lupin Sansei: Russia yori Ai wo Komete
ロックマン星に願いを
Rockman: Wishing upon a Star
僕は妹に恋をする
Boku wa Imouto ni Koi wo Suru
劇場版 鋼の錬金術師 シャンバラを行[ゆ]く者
Gekijouban Hagane no Renkinjutsushi: Shambala o Yuku Mono
劇場版 MARCO 母をたずねて三千里
Marco the Movie
年をとった鰐
Toshi wo totta Wani
扉を開けて
Tobira o Akete
新・エースをねらえ!
Shin Ace wo Nerae!
星をかった日
Hoshi wo Katta Hi
春を抱いていた
Haru wo Daite Ita
時をかける少女
Toki wo Kakeru Shoujo
機動戦士Zガンダム -星を継ぐ者-
Kidou Senshi Z Gundam: Hoshi o Tsugu Mono
正義を愛する者　月光仮面
Seigi no Asiru Mono Gekko Kamen
母をたずねて三千里
Haha o Tazunete Sazenri
満月[フルムーン]をさがして
Full Moon wo Sagashite
犬夜叉 時代を越える想い
Inuyasha - Toki wo Koeru Omoi
耳をすませば
Mimi wo Sumaseba
肢体を洗う THE ANIMATION
Shitai wo Arau
鉄仮面を追え　「ダルタニャン物語」より
Tekkamen wo oe! Dartanyan Monogatari Yori
長靴をはいたネコ
Nagagutsu wo Haita Neko
長靴をはいたネコ ８０日間世界一周
Nagagutsu wo Haita Neko: 80 Nichikan Sekai Isshuu
長靴をはいた猫の冒険
Nagagutsu o Haita Neko no Bouken
風を抜け！
Kaze wo Nuke!
風を見た少年
Kaze wo Mita Shounen
魔法のプリンセス　ミンキーモモ（夢を抱きしめて）
Mahou no Princess Minky Momo: Yume wo Dakishimete
MUNTO 時の壁をこえて
MUNTO ~Toki no Kabe wo Koete~

ああっ女神さまっ 小っちゃいって事は便利だねっ (see: AA! Megami-sama: Chichaitte Koto wa Benri da ne)
おくさまは女子高生 (see: Okusama wa Joshikousei)
おさかなはあみの中 (see: Osakana wa Ami no Naka)
おれは鉄兵 (see: Ore wa Teppei)
お江戸はねむれない！ (see: Oedo wa Nemurenai!)
お洒落小僧は花マルッ (see: Oshare Kozou wa Hanamaru)
ここはグリーン・ウッド (see: Koko wa Green Wood)
こんにちは桜の園 花の子ルンルン (see: Konnichiwa Sakura no Sono: Hana no Ko Lunlun)
ふたりはプリキュア (see: Futari wa Precure)
ふたりはプリキュア ー マックスハート (see: Futari wa Precure Max Heart)
ふたりはプリキュア Max Heart2 雪空のともだち (see: Eiga Futari wa Precure Max Heart 2: Yukizora no Tomodachi)
ふたりはプリキュア Splash Star (see: Futari wa Pretty Cure: SPLASH STAR)
るんは風の中 (see: Lunn Flies into the Wind)
カナリヤは籠の中 (see: Kanariya wa Kago no Naka)
ジャングルはいつもハレのちグゥ (see: Jungle wa Itsumo Hare nochi Guu)
ジャングルはいつもハレのちグゥ　デラックス (see: Jungle wa Itsumo Hare nochi Guu Deluxe)
ジャングルはいつもハレのちグゥ　ＦＩＮＡＬ (see: Jungle wa Itsumo Hare nochi Guu FINAL)
タッチ　Miss Lonely Yesterday　あれから、君は… (see: Touch: Miss Lonely Yesterday - Arekara, Kimi ha)
ドラゴンボールＺ 危険なふたり！超戦士はねむれない (see: Dragon Ball Z: Kiken na Futari! Super Senshi wa Nemurenai)
ドラゴンボールZ 超戦士撃破!!勝つのはオレだ (see: Dragon Ball Z: Super Senshi Gekiha!! Katsu no wa Ore da)
ブギーポップは笑わない (see: Boogiepop wa Warawanai)
ヘルメス　愛は風の如く (see: Hermes: Ai wa Kaze no Gotoku)
ママは小学4年生 (see: Mama wa Shougaku 4 Nensei)
ルパン三世 - 天使の策略（タクティクス）～夢のカケラは殺しの香り～ (see: Lupin Sansei: Tenshi no Tactics - Yume no Kakera wa Koroshi no Kaori)
ロマンスは剣の輝きII (see: Romance wa Tsurugi no Kagayaki II)
一月にはChristmas (see: Ichigatsu ni wa Christmas)
今日から俺は!! (see: Kyou Kara Ore Wa!!)
僕はこのまま帰らない (see: Boku wa kono mama kaeranai)
僕は妹に恋をする (see: Boku wa Imouto ni Koi wo Suru)
処女はお姉さまに恋してる (see: Otome wa Boku ni Koishiteru)
奥さまは魔法少女 (see: Okusama wa Mahou Shoujo)
女王様はＭ奴隷 (see: Queen and Slave)
好きなものは好きだからしょうがない！！ (see: Suki na Mono wa Suki Dakara Shou ga nai!!)
悲花陵辱~罠にはまった義兄妹(ふたり)~ (see: Hika Ryoujuku: Lust of Shame)
愛は鍵の数だけ (see: Ai wa Kagi no Kazu Dake)
敵は海賊　～猫たちの饗宴～ (see: Teki wa Kaizoku!)
新きまぐれオレンジ★ロード そして、あの夏のはじまり (see: Shin Kimagure Orange Road - Soshite, Ano Natsu no Hajimari)
映画 ふたりはプリキュア ー マックスハート (see: Eiga Futari wa Pretty Cure Max Heart)
月は東に日は西に〜Operation Sanctuary〜 (see: Tsuki wa Higashi ni Hi wa Nishi ni -Operation Sanctuary-)
森は生きている (see: Mori wa Ikiteiru)
機動戦士ZガンダムIII - 星の鼓動は愛 - (see: Kidou Senshi Z Gundam III: Hoshi no Kodou wa Ai)
遠山桜宇宙帖・奴の名はゴールド (see: Touyama Sakura Uchuu Chou: Yatsu no Na wa Gold)
銀河英雄伝説: わが征くは星の大海 (see: Ginga Eiyuu Densetsu: Waga Yuku wa Hoshi no Taikai)
銀河鉄道９９９　君は戦士のように生きられるか！？ (see: Ginga Tetsudou 999: Kimi wa Senshi no You ni Ikirareru ka?)
銀河鉄道９９９　君は母のように愛せるか！！ (see: Ginga Tetsudou 999: Kimi wa Haha no You ni Aiseru ka!!)
長靴をはいたネコ (see: Nagagutsu wo Haita Neko)
長靴をはいたネコ ８０日間世界一周 (see: Nagagutsu wo Haita Neko: 80 Nichikan Sekai Isshuu) 
長靴をはいた猫の冒険 (see: Nagagutsu o Haita Neko no Bouken)
風の名はアムネジア (see: Kaze no Na wa Amnesia)
魔法少女リリカルなのは (see: Mahou Shoujo Lyrical Nanoha)
魔法少女リリカルなのはA`s (see: Mahou Shoujo Lyrical Nanoha A`s)
“いそっぷ”のおはなしより　牛とかえる、よくばった犬 (see: From Aesop`s Tales: The Bull and the Frog / The Greedy Dog)
flutter of birds～鳥達のはばたき～ (see: Flutter of Birds ~Toritachi no Habataki~)
あしたへ フリーキック (see: Ashita e Free Kick)
あしたへアタック！ (see: Ashita e Attack!)
おにいさまへ... (see: Onii-sama e)
ドラゴンボール 最強への道 (see: Dragon Ball: Saikyou e no Michi)
ドラゴンボールＺ・絶望への反抗！！残された超戦士・悟飯とトランクス (see: Dragon Ball Z: Zetsubou e no Hankou!! Nokosareta Chousenshi - Gohan to Trunks)
ノエイン もうひとりの君へ (see: Noein - Mou Hitori no Kimi e)
ユニコ 魔法の島へ (see: Unico in the Island of Magic)
不純異性交遊 ～大切な君へ～ (see: Fujun Isei Kouyuu: Taisetsu na Kimi e)
優遇接待～孤島の極楽へようこそ～ (see: Yuuguu Settai ~Kotou no Gokuraku e Youkoso~)
劇場版甲虫王者ムシキング　グレイテストチャンピオンへの道 (see: Kabutomushi Ouji Mushiking: Greatest Champion no Michi)
北へ。 ～Diamond Dust Drops～ (see: Kita e: Diamond Dust Drops)
名探偵コナン 天国へのカウントダウン (see: Meitantei Conan: Tengoku e no Count Down)
地球へ・・・ (see: Terra e...)
夏への扉 (see: Natsu e no Tobira)
天空戦記シュラト　創世への暗闘 (see: Tenkuu Senki Shurato - Sosei e no Anto)
太陽の法　エル・カンターレへの道 (see: Taiyou no Hou: El Cantare e no Michi)
悪魔くん ようこそ悪魔ランドへ!! (see: Akuma-kun: Youkoso Akuma Land e!!)
虹のかなたへ　少女ダイアナ物語 (see: Niji no Kanata e Shoujo Diana Monogatari)
ONE ～輝く季節へ～ (see: One: Kagayaku Kisetsu e)
ONE ～輝く季節へ～ True Stories (see: ONE - Kagayaku Kisetsu e - True Stories)
Pia キャロット へ ようこそ!! (see: Pia Carrot)
Pia キャロット へ ようこそ!! 2 (see: Pia Carrot 2)
Pia キャロット へ ようこそ!! 2 DX (see: Pia Carrot 2 DX)
Pia キャロット へ ようこそ!! ~さやかの恋物語~ (see: Pia Carrot e Youkoso!! - Sayaka no Koi Monogatari)
Pia♥キャロットへようこそ!! G.O. (see: Welcome to Pia Carrot 4)